וויוביקס מדווחת על האצה חישובית של פי 16.8

וויוביקס (QXL) דיווחה כי פלטפורמת סימולציית הקוונטים שלה, המואצת באמצעות GPU, השיגה האצה חישובית של כ-פי 16.8 באמצעות מכונה אחת עם 64 ליבות ומעבד גרפי יחיד מסוג אנבידיה T4 Tensor Core GPU, בהשוואה לאותה מכונת 64-vCPU עם מימוש CPU בלבד. ההערכה השתמשה במערך נתונים קליני אמיתי של ביטוי גנים, שכלל 11 מטופלים ו-3,531 מאפייני ביטוי גנים, ומייצג סביבה מאתגרת ובעלת ממדיות גבוהה שבה מספר המשתנים הביולוגיים גדול בהרבה ממספר המטופלים. האלגוריתם הקנייני של וויוביקס, שפעל באמצעות חברת הבת CliniQuantum, חיפש תצורות מתואמות של שלושה גנים לאורך מערך הנתונים. 3,531 הגנים יצרו 7,331,162,245 צירופים אפשריים של שלושה גנים. באמצעות סף מינימלי מוגדר מראש למתאם, האלגוריתם זיהה כ-22.2 מיליון שלישיות גנים מתואמות. הניתוח דרש כ-8.4 שעות באמצעות 64 vCPU, לעומת כ-0.5 שעות כאשר הוא הואץ באמצעות GPU יחיד מסוג אנבידיה T4, תוך הפקת אותן תוצאות של שלישיות גנים שעמדו בתנאי הסף. ״זהו ציון דרך התפתחותי חשוב עבור וויוביקס,״ אמר תידהר תורג'מן, ראש תחום ניתוח נתוני ניסויים קליניים. ״מערכי נתונים קליניים ומולקולריים יכולים לכלול אלפי משתנים אך מספר קטן יחסית של מטופלים, מה שיוצר מרחבי חיפוש קומבינטוריים עצומים. היכולת שהודגמה להעריך יותר מ-7.3 מיליארד צירופי גנים פוטנציאליים על גבי נתונים קליניים אמיתיים היא צעד חשוב בפיתוח שלנו. ההאצה המשמעותית באמצעות GPU תומכת עוד יותר בהמשך הפיתוח שלנו של גישות ניתנות להרחבה, מבוססות קוונטום, לגילוי סמנים ביולוגיים ולסיווג מטופלים.״